pH值
水质中pH值的测定是评价水体酸碱性状况的重要指标。pH值代表的是溶液中的氢离子浓度，范围从0到14，其中7为中性，低于7为酸性，高于7为碱性。不同生物对pH有不同的适应要求，对某些生物来说，它甚至是生存的决定因素。在自然环境中，河流、湖泊和地下水等通常呈现弱碱或中性的特征，但受人类活动影响，如工业排放、农业废物处理等，也可能导致局部地区出现严重偏离正常范围的情况。
总氮(TN)和总磷(TP)
在水体污染控制中，总氮（TN）和总磷（TP）的监测对于预防eutrophication至关重要。这些养分通过污水排放进入水体，可以刺激藻类过度生长，从而引发藻 bloom，这不仅会破坏光照条件，还可能导致缺氧现象，对鱼类及其他 aquatic 生物造成威胁。此外，不当管理还可能引发蓝绿藻毒素产生，加剧对人畜健康风险。
有机物含量(CODCr/CODMn)
化学需氧量(COD)是衡量有机物含量的一个重要参数，它可以反映在一定条件下的能否被微生物分解成二氧化碳。这项测试包括两种方法：快速消耗法(CODCr)和慢速消耗法(CODMn)，分别用于评价不同类型污染源带来的影响。COD作为判断城市生活污水、工业废water 和农药残留等多种来源污染程度的手段，是评估整治效果的一把钥匙。
重金属
重金属如铅(Pb)、汞(Hg)、镉(Zn)、砷(As)等因其毒性极强，被列入了环境保护部门监控名单之内。当它们进入饮用水系统时，即使只有一小部分也会对人体健康构成严重威胁，因此需要进行严格监管。在日常生活过程中的使用产品如电池、灯泡以及工业生产过程中的烟囱排气，都有潜在风险向环境释放这些致命元素。
微生物指标
微生物作为一个复杂且多样化的群落，其数量变化往往能够反映出更广泛的地理学和生态学信息。例如，以Escherichia coli（E.coli）计数来评估土壤或表面上是否存在病原菌，并预示着潜在的人类健康风险。而细菌群落结构分析则提供了关于区域营养循环效率、植被覆盖情况以及自然恢复能力的一般印象，为科学研究提供了丰富数据资源。
